Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HMGCR-209ENST00000511206 3395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CEACAMP5-201ENST00000448037 961 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC020891.2-201ENST00000559672 776 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
GRIK4Q16099 AL121852.1-201ENST00000554665 430 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
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