Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 OR52E8-201ENST00000537935 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CLEC7A-205ENST00000353231 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ADA2-206ENST00000449907 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 NAT1-210ENST00000545197 1827 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
TRIM28Q13263 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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