Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC005529.1-201ENST00000411969 289 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC01060-205ENST00000512839 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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IFT88Q13099 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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IFT88Q13099 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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IFT88Q13099 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
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IFT88Q13099 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
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IFT88Q13099 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC010245.2-201ENST00000606908 1167 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
IFT88Q13099 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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