Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 AL157932.1-201ENST00000413246 363 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC099786.1-201ENST00000446238 670 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AL162632.2-201ENST00000553933 399 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 HMGCLL1-201ENST00000274901 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 TMEM108-203ENST00000508711 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 C1GALT1-201ENST00000223122 6078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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FOXC1Q12948 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 IGKV3-34-201ENST00000521692 293 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LINC01608-202ENST00000524283 561 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
FOXC1Q12948 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
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