Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF840P-201ENST00000504759 1996 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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