Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPA12A-205ENST00000635765 5841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CLDN2-201ENST00000336803 2959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 PRIMA1-202ENST00000393140 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MCOLN2-202ENST00000370608 2871 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 AC010886.1-201ENST00000437380 2869 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC25A24-203ENST00000565488 4271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJB12-203ENST00000444643 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 OXR1-202ENST00000312046 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SPTB-202ENST00000389720 6321 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 STRADA-205ENST00000447001 2014 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TTYH2-202ENST00000441391 3661 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FHDC1-201ENST00000260008 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ATXN7L3B-201ENST00000519948 7604 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM196-202ENST00000405844 4054 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 WFDC2-201ENST00000217425 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP10-8-201ENST00000334662 876 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP358-201ENST00000362973 117 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MORN5-201ENST00000373764 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA9B-201ENST00000384170 133 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGLV4-60-201ENST00000390284 362 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FTH1P19-201ENST00000402402 528 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011995.1-201ENST00000437610 578 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IMMP2L-203ENST00000437687 243 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ALG1L10P-201ENST00000437882 424 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG15-201ENST00000438705 509 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FTLP16-201ENST00000446400 513 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LSP1P3-201ENST00000449530 208 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRB1-AS1-201ENST00000456337 554 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016304.1-201ENST00000476363 413 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV3-75-201ENST00000523951 358 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL132709.1-205ENST00000556136 551 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DPPA5P4-201ENST00000559021 365 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC2L-202ENST00000561840 558 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009086.1-201ENST00000567219 309 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAPPC2L-214ENST00000568583 801 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106774.4-201ENST00000600799 409 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC215522.1-201ENST00000615488 446 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LYNX1-205ENST00000620006 868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC215522.2-201ENST00000635373 600 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC2A12-201ENST00000275230 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF200-204ENST00000414144 3306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.9 ms