Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 CDYL2-207ENST00000570137 8159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
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USP31Q70CQ4 CDKAL1-201ENST00000274695 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 C1orf162-201ENST00000343534 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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USP31Q70CQ4 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
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USP31Q70CQ4 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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USP31Q70CQ4 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 MGAM-208ENST00000549489 6525 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
USP31Q70CQ4 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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