Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC062016.2-201ENST00000420950 676 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ODF1-202ENST00000518835 368 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AF235103.1-201ENST00000530223 439 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RGS6-215ENST00000554782 1110 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
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ECM1Q16610 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 OR7D4-202ENST00000641244 4968 ntAPPRIS P1 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 E2F3-IT1-201ENST00000433182 400 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RPS18P1-201ENST00000447840 458 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
ECM1Q16610 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
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