Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
HTR4Q13639 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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