Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 KLRK1-204ENST00000540818 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
PTCH1Q13635 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
PTCH1Q13635 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
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