Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MAPRE1P3-201ENST00000435438 796 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC025187.1-201ENST00000506305 686 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC006213.5-201ENST00000619673 288 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CDH18Q13634 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
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CDH18Q13634 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
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CDH18Q13634 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CDH18Q13634 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
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