Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms