Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC136489.1-201ENST00000438181 717 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TCOF1Q13428 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 CLSTN2-201ENST00000458420 14202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
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TCOF1Q13428 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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TCOF1Q13428 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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TCOF1Q13428 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
TCOF1Q13428 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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