Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXO1Q12778 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms