Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ZSCAN12-202ENST00000396827 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SNORA70.3-201ENST00000365075 132 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC00354-201ENST00000412119 347 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 OR10J9P-201ENST00000511932 987 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 CDC42P3-201ENST00000518493 633 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC018692.2-201ENST00000624130 348 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SH2D1B-201ENST00000367929 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TGFBR3-207ENST00000525962 3927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SMTNP53814 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TSHZ2-202ENST00000371497 12187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RN7SKP118-201ENST00000364331 330 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL591503.1-201ENST00000366224 477 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 RAB7A-208ENST00000493186 329 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 FLVCR2-204ENST00000553587 584 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 CHEK2P2-201ENST00000554701 672 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SMTNP53814 TTC39C-204ENST00000577185 533 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.4 ms