Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 C7orf69-201ENST00000418326 675 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXD12P35452 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXD12P35452 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXD12P35452 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXD12P35452 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXD12P35452 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
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HOXD12P35452 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
HOXD12P35452 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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