Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC108688.1-201ENST00000485817 713 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRHP20396 AC005699.1-203ENST00000515286 688 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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TRHP20396 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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TRHP20396 AC012467.2-201ENST00000607783 2583 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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TRHP20396 NLK-201ENST00000407008 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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TRHP20396 C5orf24-201ENST00000338051 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 PECAM1-203ENST00000563924 6831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC092279.2-201ENST00000623742 2189 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 PDE6A-204ENST00000613228 5398 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 RAET1L-201ENST00000286380 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 MIR152-201ENST00000385212 87 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 FCAR-205ENST00000391723 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
TRHP20396 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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