Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CCDC73-203ENST00000531481 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NCKAP1L-201ENST00000293373 9016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SLFN13-204ENST00000526861 6004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC093014.1-201ENST00000548926 724 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 OR2T12-202ENST00000641276 5708 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 IKZF3-203ENST00000346872 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 BIVM-ERCC5-201ENST00000602836 5143 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CLASP1-203ENST00000409078 8002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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