Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 LMO3-235ENST00000616247 3227 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 OSBPL6-207ENST00000409631 3273 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 ARHGAP20-205ENST00000529591 2623 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 DTNA-226ENST00000596745 1508 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AP000295.1-201ENST00000433395 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC023968.1-201ENST00000560719 475 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC004232.1-201ENST00000571388 208 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 MIR1910-201ENST00000636955 80 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 PAICS-208ENST00000514888 3340 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 ABCB5-203ENST00000406935 1483 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 CDH17-203ENST00000450165 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RACGAP1-203ENST00000454520 3080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 S100A10-201ENST00000368809 616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 LINC01393-201ENST00000419905 746 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
HOXA3O43365 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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