Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 WNK3-203ENST00000375169 11172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 GREM1-203ENST00000622074 14606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
RNF17Q9BXT8 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AL355306.2-208ENST00000634868 1251 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
RNF17Q9BXT8 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms