Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 UNC13B-209ENST00000635942 14550 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 SLC35E3-202ENST00000398004 17791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
LRRIQ1Q96JM4 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 CLUL1-213ENST00000620089 1947 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
LRRIQ1Q96JM4 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms