Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 SOX2-OT-216ENST00000497122 578 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.48
FAM187BQ17R55 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 IGSF10-201ENST00000282466 11067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
FAM187BQ17R55 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms