Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 AC073429.2-201ENST00000569694 1444 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NRF1Q16656 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NRF1Q16656 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.2 ms