Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LCE6A-201ENST00000431011 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC00393-202ENST00000452852 485 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL139156.3-201ENST00000454802 394 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 KCTD4-201ENST00000379108 1865 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 BTRC-204ENST00000408038 5982 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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GRIK4Q16099 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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GRIK4Q16099 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 DNAJC5G-203ENST00000404433 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
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GRIK4Q16099 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
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GRIK4Q16099 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC004594.1-201ENST00000482375 463 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
GRIK4Q16099 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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