Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OR9K1P-201ENST00000326513 941 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms