Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SAMD8Q96LT4 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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SAMD8Q96LT4 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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SAMD8Q96LT4 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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SAMD8Q96LT4 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SAMD8Q96LT4 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
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