Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 SETD5-205ENST00000407969 6463 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC025428.2-201ENST00000435367 2672 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 PIK3CB-201ENST00000289153 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
COL24A1Q17RW2 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms