Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC024587.1-201ENST00000505925 2157 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CSNK1A1-205ENST00000515435 1856 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PTER-202ENST00000378000 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LINCR-0001-202ENST00000518098 524 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LINC01966-201ENST00000595809 821 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 C16orf62-202ENST00000417362 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
DUSP4Q13115 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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