Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
PTP4A2Q12974 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 LINC02039-201ENST00000507428 566 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC104109.1-201ENST00000498563 436 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
PTP4A2Q12974 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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