Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ASPH-226ENST00000522919 1277 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC023141.6-201ENST00000429418 337 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 EMX2OS-206ENST00000551288 7280 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL139231.1-201ENST00000431001 312 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.8 ms