Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 B3GNTL1P1-201ENST00000509174 289 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR52H2P-201ENST00000514607 902 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC02482-202ENST00000515205 422 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR5AP2-201ENST00000544374 1006 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ANP32BP1-202ENST00000568553 737 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RMDN2-AS1-207ENST00000627614 765 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC01440-201ENST00000416190 1340 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 CASC15-201ENST00000444265 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NUP210L-201ENST00000271854 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNASE13-201ENST00000382951 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC006213.6-201ENST00000623722 4179 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AL035665.1-201ENST00000428495 1669 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RAP1GDS1-204ENST00000408900 1942 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RIOK2-202ENST00000508447 2149 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 NPHP3-AS1-202ENST00000504440 2507 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 LINC01676-201ENST00000420901 410 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 AC004470.1-201ENST00000442155 382 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CHRNEQ04844 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms