Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC044810.1-201ENST00000480271 711 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 RUNX1T1-234ENST00000521553 1346 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AP002004.1-203ENST00000531091 1768 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
FGD1P98174 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 GGA1-205ENST00000405147 575 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 QKI-206ENST00000424802 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 LINC01217-201ENST00000514427 562 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC138517.1-201ENST00000515724 568 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 NPIPB14P-203ENST00000532298 987 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 LINC01916-201ENST00000582028 559 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 LINC01855-201ENST00000585520 396 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
FGD1P98174 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms