Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC090673.2-201ENST00000544279 454 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AL356017.1-201ENST00000556796 594 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AC012447.1-201ENST00000577914 682 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AC098847.2-201ENST00000588088 528 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AL008638.3-201ENST00000623027 5182 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 CLCC1-203ENST00000356970 4803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 UTY-210ENST00000538878 6574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
PTPREP23469 ZNF438-208ENST00000538351 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 DNMBP-203ENST00000543621 4178 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 SRFBP1-201ENST00000339397 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AL355974.1-201ENST00000618896 1708 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 RORA-202ENST00000309157 1908 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 HKR1-203ENST00000541583 2758 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 LINC00184-201ENST00000429269 2270 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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PTPREP23469 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
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PTPREP23469 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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PTPREP23469 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
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PTPREP23469 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 Z99129.3-201ENST00000624363 6430 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
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PTPREP23469 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 CASP10-203ENST00000313728 1521 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
PTPREP23469 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
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