Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MYOF-201ENST00000358334 6680 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 STON1-202ENST00000406226 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PRICKLE2-201ENST00000295902 7918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC105105.2-201ENST00000590797 4521 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 FCF1-203ENST00000553615 954 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC00254-201ENST00000563416 662 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC093829.1-201ENST00000506662 1618 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ABCA4-201ENST00000370225 7309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PPARA-203ENST00000407236 9995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CTNND1-221ENST00000529873 5931 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SVIL-202ENST00000375398 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ZNF100-202ENST00000358296 5745 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 DNAH11-202ENST00000409508 14167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 VWA3A-202ENST00000389398 4600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
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