Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC098869.2-201ENST00000514187 862 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC112206.2-204ENST00000504068 793 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
ZBED1O96006 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms