Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL138737.1-201ENST00000456896 1252 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AL158062.1-201ENST00000619632 745 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
MTSS1O43312 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MTSS1O43312 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms