Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 TRIM34-201ENST00000429814 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 VPS8-201ENST00000287546 5047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 NAA15-208ENST00000515576 2456 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 RORA-201ENST00000261523 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SYTL5-201ENST00000297875 4722 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
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USP17L18D6R9N7 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
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USP17L18D6R9N7 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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USP17L18D6R9N7 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 HMBOX1-206ENST00000519047 1551 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 SAR1A-206ENST00000431664 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 DNM1L-205ENST00000414834 4211 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CA1-222ENST00000523953 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 LRRC37A3-203ENST00000339474 2589 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP17L18D6R9N7 CTAGE11P-201ENST00000451540 2353 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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