Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 NUDT13-201ENST00000349051 1835 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ZBTB8OSP2-201ENST00000423890 504 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 GAPDHP69-201ENST00000425504 1008 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL121908.1-201ENST00000443055 668 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC013787.1-201ENST00000460165 307 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RPSAP24-201ENST00000461543 873 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL861P-201ENST00000473793 285 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC009269.1-202ENST00000484381 469 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 PDCL3P1-201ENST00000534575 734 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 PRR13-204ENST00000547368 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC134312.6-201ENST00000568587 444 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF730-201ENST00000593635 464 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC004448.4-210ENST00000610229 833 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 HTR1DP1-201ENST00000616500 888 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 SPTY2D1-AS1-206ENST00000636011 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CASC23-201ENST00000534076 1563 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MSL3P1-201ENST00000438684 2032 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 NPIPB5-207ENST00000451409 3660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 DCAF8-203ENST00000368074 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CLRN1-AS1-202ENST00000476886 2223 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 SELP-201ENST00000263686 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CALML4-203ENST00000395465 4155 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CLSPN-201ENST00000251195 4769 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 RPS20-205ENST00000519807 1826 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 TCF7L2-209ENST00000369395 1541 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CACNA1D-219ENST00000636938 6868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 CLEC2D-203ENST00000290855 5279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
SPOCK3Q9BQ16 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 SPATA31A3-201ENST00000428649 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 SPATA31A5-201ENST00000437823 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 PTPN3-201ENST00000262539 6832 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 RIT2-201ENST00000326695 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 AL450468.1-201ENST00000415166 450 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 YWHAZP3-201ENST00000415292 738 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
SPOCK3Q9BQ16 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms