Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P18-201ENST00000469899 480 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC02416-201ENST00000550019 540 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL544P-201ENST00000617232 284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL763P-201ENST00000620922 284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms