Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 SNRPEP6-201ENST00000407465 277 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 PHKBP1-201ENST00000450951 1951 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 AC083899.2-201ENST00000423285 1376 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
BRD3Q15059 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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BRD3Q15059 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
BRD3Q15059 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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