Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC079841.1-201ENST00000481228 950 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AP003696.1-201ENST00000519337 770 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RN7SKP273-201ENST00000411392 314 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
CNGB1Q14028 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms