Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AP000233.1-201ENST00000426609 291 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ATP1A4Q13733 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms