Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC007064.3-201ENST00000422608 359 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC130364.2-201ENST00000528639 604 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AC009237.13-201ENST00000603193 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SRSF5Q13243 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms