Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SSX2B-202ENST00000596480 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZNF268-206ENST00000536899 3236 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 GIMAP8-201ENST00000307271 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC000099.1-202ENST00000413812 1912 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DGKG-203ENST00000382164 3152 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CLASP1-208ENST00000455322 5660 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 MPEG1-201ENST00000361050 4442 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 LDB2-203ENST00000502640 2626 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 FAM13A-205ENST00000503556 3386 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ANKS1B-220ENST00000550693 3372 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ACSL1-211ENST00000515030 3948 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 CACNB2-201ENST00000282343 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AP001043.1-202ENST00000380931 5027 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RBMX2P2-201ENST00000257020 946 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RNA5SP185-201ENST00000390963 114 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 CCDC39-201ENST00000442201 3279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PSMC2-201ENST00000292644 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 AC015813.3-201ENST00000584805 6113 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 DHFR2-201ENST00000314636 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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MKRN3Q13064 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PAICS-202ENST00000399688 3297 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZNF350-201ENST00000243644 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PAX8-AS1-201ENST00000333145 2319 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 PIK3AP1-203ENST00000371110 3151 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
MKRN3Q13064 ZNF569-202ENST00000392149 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
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