Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FAM227A-205ENST00000535113 10322 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ANKRD31-201ENST00000274361 6036 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MUC5B-204ENST00000529681 17911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CASKP1-201ENST00000412870 582 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 NDUFA5P8-201ENST00000449019 346 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 ITSN2-213ENST00000622089 5805 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
BPTFQ12830 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.1 ms