Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SCAPQ12770 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AL359955.1-201ENST00000455242 3275 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
SCAPQ12770 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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