Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf57-201ENST00000377024 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC003685.1-201ENST00000440430 466 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 G6PC2-203ENST00000421979 494 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
NEDD8-MDP1E9PL57 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms