Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL136987.1-201ENST00000434300 396 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC092134.1-201ENST00000563690 800 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
TRAPPC9Q96Q05 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms