Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 PGM3-215ENST00000616566 5905 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 NUP214-202ENST00000411637 7538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 HIGD1AP12-201ENST00000427832 281 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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USP31Q70CQ4 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
USP31Q70CQ4 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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