Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 SPTA1-201ENST00000368147 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 CTNND1-236ENST00000533667 4990 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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COL24A1Q17RW2 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
COL24A1Q17RW2 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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